一、上部循环过滤
在鱼缸水体之上设置一个过滤槽，过滤槽内依次布置过滤棉、生化棉、生化滤材。鱼缸内的水体通过循环水泵上升进入过滤槽，然后再由过滤槽下部的出水口流回原缸内。这样一套循环系统统称为上部循环过滤系统。因为其具有结构简单、价格低廉等特点深受小型观赏鱼水族店的青睐。但是这种过滤系统也存在一定弊端，即过滤槽内空间狭小滤材较少，导致过滤能力相对有限。上部循环过滤系统属于开式过滤系统，会在水体流动期间造成二氧化碳逃逸。因此，此过滤系统并不适合草缸使用。
二、滴流式过滤
滴流式过滤的原理与上部循环过滤基本类似，但是滴流式过滤的过滤槽则更加完善，其过滤槽分为上下几层，其中涵盖了物理过滤区、生化过滤区和培菌区。当水流由上至下的顺序通过每个分区时会与氧气充分接触，为硝化细菌的培养和增殖提供必要的支持。也使水体的过滤层次相对完整。但是由于上部过滤槽层数过多的原因会影响鱼缸的整体美观，同时水流会在滴流的过程中产生一定的噪音。
三、外挂式过滤桶
外挂式过滤桶是一种封闭的过滤形式，其滤桶内部有多层结构用于放置不同的滤材。水流从进水口流入，经过滤材后由出水口流出。因为其闭式循环系统可以有效地防止二氧化碳的逃逸，加之噪音小、生化过滤效果较好、安装灵活等特点比较适合草缸的使用。但是外挂式过滤桶的清洗和启动比较麻烦，物理过滤效果相对较弱。
四、底缸过滤
底缸过滤是充分利用鱼缸底柜的空间而设置的大型底缸过滤槽，较大的底缸内可以放置数量可观的滤材，也可以更好地对过滤区域进行划分。底缸与主缸通过管道连接，利用水泵完成整个水体的循环。底缸过滤的优点是上部鱼缸简洁美观，对于整个水体的操作都可以在底缸中进行。但是美中不足的则是整体造价较高，耗电量较大。
五、反气举式过滤
反气举式过滤系统就是我们常说的水妖精过滤，其工作原理是出气口出气，带动水流上升，从而使水流从海绵外侧向海绵内侧流动，为硝化细菌在多孔隙的海绵内寄生提供有利条件。反气举式过滤的生化效果和增氧效果比较明显，同时价格便宜、安装方便，深受广大鱼友的喜爱。但是水妖精过滤能力有限，面对过大的水体和负担时会有些力不从心。
